A história do Frigo Eder S/A - Frigorífico Santo Amaro teve início no ano de 1923, quando os imigrantes alemães Alexandre Eder e Max Satzke fundaram o primeiro frigorífico especializado em embutidos no Estado de São Paulo, no então Município de Santo Amaro, onde desde suas origens sediou-se a empresa Alexandre Eder e Cia.
Naquele primeiro quarto de século, a região começava a atrair um grande número de imigrantes Europeus, principalmente Germânicos. Foram estes Europeus os primeiros consumidores das salsichas, presuntos, frios e linguiças produzidas pela Eder e Cia com a mesma técnica e padrão de qualidade dos similares Europeus. Mas rapidamente estes produtos, desconhecidos nas mesas dos Brasileiros, conquistaram outros segmentos da população.

Para atender a crescente demanda de frios e outros produtos fabricados pela empresa, Alexandre Eder e seu sócio, sempre atentos ao binômio padrão de qualidade/diversificação de produtos, continuam a investir na expansão do frigorífico. E, em 1936, já contam com cerca de setenta funcionários e uma empresa consolidada.

Em 1960, quando assume a segunda geração de proprietários, foi construído o abatedouro na fazenda da empresa em Itapecerica da Serra, e o rebanho próprio é ampliado.

Já nos anos 80 começa a construção de uma nova fábrica.
Em 1998, o frigorífico Eder Santo Amaro passa a administração e controle de novos proprietários. O frigorífico Pesarese, desde 1959 produzindo frios e embutidos, adquire a marca e "Know-How" de fabricação.

A aceitação é total, já que a fábrica trabalha com equipamentos e máquinas de última geração, mais de 200 funcionários, nutricionistas, técnicos e inspeção federal permanente. No começo a produção teve a assessoria de João Eder e logo após, o diretor industrial Adriano Olmeda, fez um curso e trabalhou em uma das mais importantes fábricas de frios e embutidos da Bavária (Alemanha), com 100 anos existência.

A partir de 2008 a Eder Santo Amaro passa a ser administrada pelos novos proprietários o Grupo Arantes Alimentos.